3—5 октября 1908 г. состоялся I съезд БУ в Джокьякарте, закрепивший приход к руководству наследственной феодальной бюрократии. Председателем стал областной начальник прияи Арьо Тиртокусумо, который больше заботился о возможной реакции колониального правительства на деятельность БУ, нежели об отклике коренного населения. Вскоре в БУ наметился раскол: выделилось левое, демократическое крыло, представленное в основном учащейся молодежью, и правое, элитарное, умеренно-консервативное. Видя одну из главных задач в просвещении, левые добивались создания сети сельских школ, образования для широких масс; правые же доказывали, что начинать следует с «более подготовленной» элиты и лишь на втором этапе просвещать народ. Соответственно, хотя оба крыла признавали необходимость овладеть передовой голландской наукой и культурой, левые делали акцент на обретение профессионально-прикладных знаний в области точных наук, агрикультуры, коммерции; правые же ставили во главу угла овладение голландским языком и приобретение западных административных навыков. Большинство правых сочувствовало идее «ассоциации» С. Хюргронье, которую более радикально настроенное молодежное крыло отвергало. Общими требованиями обеих фракций БУ были поддержание на высоком уровне «национальной этики», принцип свободы вероисповедания, намерение придать организации общеиндонезийский характер. В соответствии с последним предлагалось использование союзом как средства общения не сложного яванского, а более простого и широко распространенного в Нусантаре малайского (индонезийского)   языка.