Распад общинного строя, внутренние противоречия и иноземное господство оказали существенное влияние на племена Аравии. В VI—VII веках среди них получил распространение ханифизм, ставший основой сложной монотеистической религии — ислама.
Ислам стал знаменем более мощного освободительного движения и вскоре поднял на борьбу арабов района Персидского залива. Когда в 621 году на архипелаг прибыл представитель «пророка» Мухаммеда, вожди племен Абд аль-Кайс и Бени Бекр восстали против иранского господства. Борьба длилась два года, и Бахрейн стал частью арабского государства.
Превращение Бахрейна в оплот «новой веры» оказало существенное влияние на его политическую и экономическую жизнь. «Либерализм золотого века ислама» способствовал развитию на архипелаге традиционных ремесел и промыслов, земледелия и животноводства; возродилась и торговля. Бахрейн стал культурным, экономическим и политическим центром района Персидского залива, пользующимся относительной независимостью.
Пришедшая вскоре к власти династия халифов Омейядов (661—750) внесла существенные коррективы в статут Бахрейна.
Правящие круги халифата (его центром был Дамаск) настояли на объединении Бахрейна с Оманом в единую провинцию, во главе которой стал наместник.
В VII—VIII веках халифат потрясли мощные антифеодальные выступления, которые предшествовали приходу к власти и династии Аббасидов (750—1258), перенесшей столицу халифата в Багдад. На рубеже VIII и IX веков халифат стал распадаться на части. Этому способствовало восстание рабов-зинджей (869— 883 гг.) в Южной Месопотамии, поддержанное рядом нелегальных религиозных сект, в том числе сектой карматов, которые выступили против Аббасидов.
В 894 году карматское восстание охватило Бахрейн. В 899 году, изгнав из Бахрейна багдадского наместника, карматы создали на архипелаге и в прилегающих к нему областях побережья независимое государство с центром в Ляхсе.
Особого расцвета государство карматов достигло во второй половине X века, когда всеми его делами занялся совет из шести выборных членов. В это время Бахрейн превратился в центр крупного государства, игравшего выдающуюся роль в культурной, экономической и политической жизни средневекового Востока.
В начале XI века государство карматов вступило в полосу кризиса и стало распадаться на части.
